不同分子检测策略诊断手足口病住院患儿肠道病毒的一致性

目的 本研究旨在了解单纯实时荧光定量逆转录聚合酶链式扩增技术(fluorescence -based quantitative real-time reverse transcription-polymerase chain reaction, qRT-PCR)及qRT-PCR联合巢式聚合酶链式反应(nested polymerase chain reaction,nested PCR)测序两种检测策略在检测手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)住院患儿肠道病毒的一致性及其相关因素.方法 2017年2月-2018年2月在河南省建立以医院为基础的HFMD住院患儿前瞻性队列,收集研究对象相关信息并采集生物标本,分别开展单纯qRT-PCR及qRT-PCR联合nested PCR测序的肠道病毒核酸检测.结果 两种检测策略总体的一致性较好(kappa＞0.60).标本类型、肠道病毒A组71血清型(enterovirus-A71,EV-A71)疫苗接种史、发病到采样时间、疾病严重程度以及年龄与肠道病毒的检出收益相关.qRT-PCR联合nested PCR测序的样本采样时间≥4 d、不同检测策略的样本采样时间差＞2 d会降低两种检测策略EV-A71矫正机遇后的一致性,而重症与EV-A71矫正机遇后的高一致性有关.标本类型(P=0.033)及疾病严重程度(P=0.020)是两种检测策略柯萨奇病毒A组16(coxsackievirus-A 16,CV-A16)矫正机遇后一致性的独立相关因素.结论 qRT-PCR及qRT-PCR联合nested PCR测序的两种检测策略的一致性较好,患儿个体情况及标本采集时间会影响分子检测的检出收益及一致性.